על רקע הצפי להכפלת מספר הטסים מישראל וממנה, מ-15 מליון נוסעים היום לכ-30 מליון נוסעים בעוד כ- 20 שנה, החליטה מדינת ישראל לקדם הקמת שדה תעופה בינלאומי בנוסף לנתב"ג. לשם כך, הקים משרד התחבורה ועדה מיוחדת בראשותו של מפקד חיל האוויר לשעבר, אלוף במיל' הרצל בודינגר, אשר תמליץ על חלופות אפשריות למיקום שדה התעופה. הוועדה המליצה כי מנחת מגידו, הנמצא בלב עמק יזרעאל, יהיה החלופה המועדפת אך במקביל יש לבחון מספר חלופות נוספות: צקלג 2 - ליד נתיבות, נבטים - ליד ירוחם, הרחבת נתב"ג במקומו הנוכחי והקמת אי מלאכותי בים. ממשלת ישראל אישרה את המלצות הוועדה באחת מהישיבות האחרונות של ממשלת אולמרט.
לאחר שקיבלו חוות דעת מומחים רבים מתחומי התחבורה, התעופה והסביבה אשר העידו כי קיימות אלטרנטיבות בישראל שלא ייצרו נזק עצום לסביבה ולתושבים כפי שעתיד לעשות נתב"ג 2 במגידו, קבוצת המתנגדים התגבשה והחלה את המאבק לשינוי ההחלטה. מטה המאבק טוען כי להערכת אותם גורמים מקצועיים - הקמת השדה במגידו תיצור הרס טוטאלי של הנוף, האדמה והמורשת הישראלית. לטענת המטה, החלופה המוצעת במגידו היא אבסורד מוחלט מאחר ואינה משרתת את האינטרס הלאומי של מדינת ישראל שהוא שימור שטחים פתוחים, שימור עתודות הקרקע החקלאיות המשמעותיות של עמק יזרעאל, פיתוח תיירות כפרית ושימור אזורים בעלי רגישות סביבתית ואקולוגית.
המתנגדים לתוכנית אינם רואים בפיתוח ובקדמה איום, אולם שדה תעופה איננו מהווה חלופה הולמת לרצון לייצר מקומות עבודה ופרנסה לתושבי העמק. המתנגדים רואים בעידוד ענף התיירות, חיזוק המגזר ההתיישבותי, פיתוח תשתיות הרכבת ופיתוח ישובים כפריים את עתידם ומקור פרנסתם. עוד טוען מטה המאבק כי ועדת בודינגר, כמו גם ממשלת ישראל, לא ביצעה סקרים סביבתיים במסגרת עבודתה, התעלמה לחלוטין משיקולי סביבה, בריאות, סוגי אוכלוסיה, אופי האזור ורצון התושבים. ממשלת ישראל לא בחנה את האלמנטים הללו כאשר קיבלה את החלטה. הדיון החפוז בממשלה, לצד חוסר ההתייחסות לדעותיהם של תושבי עמק יזרעאל, הינו בגדר מחטף פוליטי המבקש לייצר כותרות של עשייה של ממשלה בשלהי פעילותה.
הכוונה להקים את שדה התעופה בלב עמק יזרעאל עומדת בניגוד מוחלט לתוכנית מתאר ארצית 35 העוסקת בשטחים פתוחים ומגדירה את האזור כמיועד לשימור וחיזוק הפן החקלאי והכפרי שבו.
ההחלטה להמליץ על מגידו כחלופה מועדפת עומדת בסתירה גמורה לרצונם של תושבי האזור הוותיקים אשר עבדו את אדמות העמק ומתפרנסים מחקלאות ומתיירות כפרית ובניגוד גמור לרצונם של תושבי העמק החדשים אשר שיפרו את איכות חייהם במעבר לאזור כפרי, שלו ובעל איכות חיים גבוהה המושתת על סביבה בריאה ושטחים פתוחים.
חנן ארז, ראש המועצה האזורית מגידו: "הכוונה להקים בלב עמק יזרעאל את נתב"ג 2 היא החלטה אומללה הפוגעת באינטרסים החיוניים של מדינת ישראל. נתב"ג 2 יפגע אנושות במרקם החיים הכפרי של המקום, יחסל את עתודות הקרקע החקלאיות, יביא לזיהום סביבתי באזור רגיש ויהרוס כליל את ענף התיירות הפורח המביא לעמק מאות אלפי ישראלים המבקשים ליהנות מאיכות החיים ומהשטחים הפתוחים במקום. הקמת נתב"ג 2 בעמק תוביל לעיור ופרבור מואץ, תיעוש חסר פרופורציות ויצירת אזור בעל מאפיינים עירוניים. זהו לא האינטרס הלאומי וזה לא האינטרס של תושבי העמק".
המועצה האזורית מגידו נפגשה עם וועדת בודינגר והציגה את התנגדותה לתוכנית, הוועדה דרשה כי טענותיה יילקחו בחשבון וכי מיקום שדה התעופה אינו יכול לקחת בחשבון את התנגדות חיל האוויר לחלופות מסוימות כטיעון מועדף.
ניצב בדימוס אליק רון, תושב תל עדשים, אמר: "2 מרכיבים מהותיים בחייו של עם: המורשת - אותה יש לשמר, והחזון- אותו יש להגשים. מחד - מורשת העמק, אותה טבע יהושע חנקין, דוגלת בגאולת אדמות עמק יזרעאל למען החקלאות וההתיישבות, מאידך - חזונו המפורסם של בן גוריון ליישוב הנגב, נכון לתקופתנו, לא הגשים עצמו במלואו ונותר כריק מתוכן. זו השעה לשמר את מורשת עמק יזרעאל ולהגשים חזונו של דוד בן גוריון ביישום תוכנית הקמת נתב"ג 2 בנגב. עמק יזרעאל, כאסם החקלאות הגדול במדינה, מכיל בתוכו את בסיס חיל האוויר רמת דוד, אשר עימו למדנו לחיות בשוויון נפש מתוקף חשיבותו. אין סיבה שתושבי עמק יזרעאל ייאלצו להתמודד עם נתב"ג 2, קל וחומר כאשר השיקול הביטחוני, בשל קרבתה הפיסית של מגידו לג'נין, אמור להיות נר לרגליה של הממשלה בעת קבלת החלטות מסוג זה."
מיקי ליפשיץ מעמותת "עמקים ומרחבים": "אני מצר על כך שלא יושבים כאן כתף לצד כתף גם ראש מועצה אזורית הגלבוע, דני עטר וראש עיריית עפולה, אבי אלקבץ, שהייתי רוצה שיעדיפו את שימור העמק כמו שהוא על פני שיקולים חד ממדיים. על סמך ערבי הסברה שהעמותה מנהלת - לתושבי העמק יש ראיה סביבתית נכונה והם מתנגדים להקמת נתב"ג 2. לייזמי נתב"ג 2 יהיה מאבק קשה, עם קבוצת ארגונים ואלפי אנשים שמבינה מה עומד בפניהם ובכוונתם להתנגד למהלך מטופש זה".
